Při provozu tepelného čerpadla vzniká vodní kondenzát – na povrchu výparníku se sráží voda a kondenzuje. Nejvíce kondenzátu vzniká při venkovních teplotách kolem bodu mrazu, a to až desítky litrů denně.
Správné odvádění vodního kondenzátu se musí vyřešit již při návrhu tepelného čerpadla. Jinak by mohlo dojít k poškození zařízení nebo nasáknutí vody do stěn domu. Odvod vodního kondenzátu se nejčastěji provádí pomocí drenážního výkopu (do nezámrzné hloubky – 80 cm), odvodem přímo do kanalizace, případně svodem daleko od domu.